生态工程净化水质技术从 20 世纪 70 年代始成为一种先进的净化水质理念。传统水利基本上是依靠工程手段来治水的。而后来对于水质恶化多采用物理、化学的方法，这样花费大且不能一次性解决问题。生态工程净化水质则是将河流及所在流域的生物群落统一进行考虑及规划。对江河与湖泊开发利用的同时，在达到防洪标准的条件下，尽可能地保留其天然形态，保留并恢复其多样性，例如恢复湿地、浅滩和河湾等。

其目的是使受损生态系统的结构和功能恢复到正常的自然状况。生态工程净化水质技术有多种方法，按照工程措施可分为：生态河道、生态堤岸、人工湿地，按照生态工程的主导可分为：植物生态工程、微生物生态工程、动物生态工程以及植物微生物动物相结合的工程。

主要技术措施有、缓冲区工程、植被工程等技术。缓冲区修复是通过沉淀、过滤、净化洪水中污染物以改善水质，达到净化水体的目的;植被工程是利用植物生长过程需要吸收大量氮、磷作为营养物质合成自身物质的这一生理生化特性，对河流的流动、河岸抗冲刷强度、泥沙沉积等产生良性影响，达到稳定水质的作用;通过生态工程净化水质技术，使得河流的水质得到净化。

种植水生植物，特别是大型水生植物作为改善水质的一种高效低耗的方法日益受到人们的重视，近年来已成为环境领域的研究热点之一，多种以大型水生植物为核心的生态工程技术被开发并应用到实际中来。

生态系统修复技术的应用可以使所在地野生动植物(包括水生和陆生植物、鸟类和鱼类等动物)更好的栖息繁衍。对水体的生态净化方法，即包括动物的吞食、吸收作用，植物对营养盐等的吸收作用以及微生物的分解作用等，通过动植物及微生物的共同作用，以及水体中污染物质的迁移和转化作用对水体进行生态修复。